所有發(fā)酵的微生物屬于“好氧的”都存在消泡的問題。據(jù)估計目前有機硅消泡劑在這些行業(yè)用量只占這些行業(yè)消泡劑總體使用量的1/10左右，甚至還不到。

同樣使用消泡劑的另一大行業(yè)是生物發(fā)酵，它包括青霉素、土霉素等常用的抗菌素，獸藥如桿菌肽鋅，食品如谷氨酸、賴氨酸、檸檬酸、啤酒等等。凡是發(fā)酵的微生物屬于“好氧的”都存在消泡的問題。據(jù)估計目前有機硅消泡劑在這些行業(yè)用量只占這些行業(yè)消泡劑總體使用量的1/10左右，甚至還不到，只是在發(fā)酵底料中用一些，用以在發(fā)酵初期抑制泡沫的產(chǎn)生， 在整個發(fā)酵過程中的消泡仍然在大量的使用聚醚。是普通乳液型有機硅消泡劑不能勝任發(fā)酵的特殊要求嗎?回答是肯定的。

目前普通的乳液型有機硅消泡劑無法勝任發(fā)酵的特殊要求，因為發(fā)酵消泡劑在使用前要經(jīng)過125℃以上高溫殺菌，有的甚至還要加部分水稀釋以后再高溫殺菌。這個高溫足以使所有的耐酸堿高溫消泡劑(乳液型消泡劑)，產(chǎn)生破乳、漂油、分層、油水分離，而乳液型有機硅消泡劑只有當它是乳化狀態(tài)時，才具有良好的消泡性;其次，有機硅乳液型消泡劑，對于粘度大的富含淀粉和蛋白質(zhì)的起泡液，消泡速度慢、消泡效果差。這正好像聚醚類消泡劑用來消除表面活性劑水溶液的泡沫消泡慢、效果差一樣。由于消泡理論國際上尚無統(tǒng)一的認識，因此學術(shù)界對它的研究一直在進行，國際上最新的消泡理論，把消泡劑分成“快消泡劑”和“慢消泡劑”兩種類型，“快消泡劑”的消泡機理是所謂消泡活性物顆粒的“架橋”、“去濕”機理，而“慢消泡劑”的消泡機理是所謂“PBS區(qū)排濕”原理，兩者機理不同。

耐酸堿高溫消泡劑在發(fā)酵液中的快速消泡能力，使得它能在泡沫大量產(chǎn)生時迅速的消除泡沫，防止泡沫從發(fā)酵罐的排氣孔溢出，造成染菌等生產(chǎn)事故;所以能在發(fā)酵行業(yè)得到廣泛的應用。但是最大的缺點是沒有抑泡能力，或者說抑泡能力極差。凡熟悉發(fā)酵的人都知道，當發(fā)酵的泡沫被加入聚醚消泡劑消除到能見到液面后，幾乎在同時泡沫又開始生起，并逐漸積累上升到原來的高度，這期間并沒有泡沫不再產(chǎn)生的時間，也就是常說的消泡劑的抑泡時間。這些缺陷是由聚醚的分子結(jié)構(gòu)所決定的。